Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms