Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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MRPL28Q13084 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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MRPL28Q13084 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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