Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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