Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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