Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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