Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms