Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms