Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD47Q08722 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms