Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms