Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms