Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TFF3Q07654 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TFF3Q07654 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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TFF3Q07654 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TFF3Q07654 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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TFF3Q07654 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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TFF3Q07654 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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