Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP1-1Q07627 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms