Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms