Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms