Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms