Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APBA1Q02410 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms