Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms