Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms