Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms