Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDR2Q01850 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms