Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms