Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TRA2BP62995 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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