Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 GPR179-203ENST00000616987 7980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 OTOG-202ENST00000399391 8778 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms