Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms