Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIK1P57059 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIK1P57059 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIK1P57059 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIK1P57059 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIK1P57059 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIK1P57059 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIK1P57059 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIK1P57059 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIK1P57059 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIK1P57059 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIK1P57059 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIK1P57059 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SIK1P57059 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIK1P57059 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIK1P57059 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIK1P57059 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIK1P57059 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIK1P57059 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIK1P57059 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIK1P57059 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIK1P57059 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIK1P57059 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIK1P57059 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIK1P57059 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIK1P57059 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIK1P57059 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIK1P57059 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIK1P57059 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIK1P57059 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIK1P57059 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIK1P57059 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SIK1P57059 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIK1P57059 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIK1P57059 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIK1P57059 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIK1P57059 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIK1P57059 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIK1P57059 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SIK1P57059 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIK1P57059 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIK1P57059 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIK1P57059 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIK1P57059 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIK1P57059 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIK1P57059 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIK1P57059 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIK1P57059 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIK1P57059 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIK1P57059 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIK1P57059 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIK1P57059 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIK1P57059 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIK1P57059 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIK1P57059 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIK1P57059 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SIK1P57059 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SIK1P57059 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIK1P57059 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SIK1P57059 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIK1P57059 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SIK1P57059 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SIK1P57059 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms