Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COPAP53621 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPAP53621 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPAP53621 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPAP53621 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPAP53621 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPAP53621 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPAP53621 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPAP53621 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPAP53621 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPAP53621 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPAP53621 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPAP53621 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
COPAP53621 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
COPAP53621 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPAP53621 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPAP53621 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPAP53621 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPAP53621 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPAP53621 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPAP53621 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPAP53621 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COPAP53621 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COPAP53621 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COPAP53621 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COPAP53621 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COPAP53621 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COPAP53621 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COPAP53621 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
COPAP53621 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPAP53621 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPAP53621 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPAP53621 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPAP53621 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPAP53621 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPAP53621 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPAP53621 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPAP53621 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms