Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PGGT1BP53609 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PGGT1BP53609 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PGGT1BP53609 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PGGT1BP53609 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PGGT1BP53609 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PGGT1BP53609 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PGGT1BP53609 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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PGGT1BP53609 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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PGGT1BP53609 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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PGGT1BP53609 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PGGT1BP53609 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PGGT1BP53609 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PGGT1BP53609 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PGGT1BP53609 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PGGT1BP53609 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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