Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms