Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP153P49790 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP153P49790 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP153P49790 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP153P49790 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP153P49790 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP153P49790 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP153P49790 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP153P49790 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP153P49790 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP153P49790 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP153P49790 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP153P49790 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP153P49790 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP153P49790 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP153P49790 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP153P49790 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP153P49790 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP153P49790 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP153P49790 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP153P49790 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP153P49790 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP153P49790 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP153P49790 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP153P49790 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP153P49790 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP153P49790 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP153P49790 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP153P49790 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP153P49790 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP153P49790 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP153P49790 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP153P49790 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP153P49790 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP153P49790 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP153P49790 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP153P49790 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP153P49790 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP153P49790 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP153P49790 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP153P49790 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP153P49790 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP153P49790 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP153P49790 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP153P49790 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP153P49790 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP153P49790 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP153P49790 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP153P49790 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP153P49790 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP153P49790 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP153P49790 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NUP153P49790 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NUP153P49790 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NUP153P49790 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NUP153P49790 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NUP153P49790 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP153P49790 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP153P49790 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP153P49790 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP153P49790 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP153P49790 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP153P49790 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP153P49790 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP153P49790 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP153P49790 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP153P49790 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP153P49790 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP153P49790 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP153P49790 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP153P49790 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP153P49790 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP153P49790 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP153P49790 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP153P49790 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP153P49790 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP153P49790 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP153P49790 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP153P49790 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms