Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FNTAP49354 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FNTAP49354 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FNTAP49354 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FNTAP49354 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FNTAP49354 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FNTAP49354 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FNTAP49354 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FNTAP49354 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FNTAP49354 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FNTAP49354 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FNTAP49354 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FNTAP49354 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FNTAP49354 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FNTAP49354 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FNTAP49354 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FNTAP49354 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FNTAP49354 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FNTAP49354 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FNTAP49354 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms