Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NESP48681 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NESP48681 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NESP48681 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NESP48681 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NESP48681 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NESP48681 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NESP48681 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NESP48681 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NESP48681 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NESP48681 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NESP48681 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NESP48681 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NESP48681 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NESP48681 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NESP48681 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NESP48681 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NESP48681 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NESP48681 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NESP48681 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NESP48681 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NESP48681 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NESP48681 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NESP48681 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NESP48681 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NESP48681 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NESP48681 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NESP48681 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NESP48681 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NESP48681 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NESP48681 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NESP48681 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
NESP48681 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NESP48681 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NESP48681 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NESP48681 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NESP48681 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NESP48681 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NESP48681 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NESP48681 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NESP48681 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NESP48681 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NESP48681 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NESP48681 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NESP48681 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NESP48681 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NESP48681 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NESP48681 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NESP48681 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NESP48681 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NESP48681 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NESP48681 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NESP48681 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NESP48681 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NESP48681 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NESP48681 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NESP48681 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NESP48681 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NESP48681 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NESP48681 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NESP48681 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NESP48681 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NESP48681 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NESP48681 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NESP48681 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NESP48681 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NESP48681 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NESP48681 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NESP48681 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NESP48681 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NESP48681 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NESP48681 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NESP48681 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NESP48681 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NESP48681 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NESP48681 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NESP48681 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NESP48681 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NESP48681 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NESP48681 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NESP48681 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NESP48681 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NESP48681 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NESP48681 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NESP48681 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NESP48681 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NESP48681 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NESP48681 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NESP48681 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NESP48681 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NESP48681 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NESP48681 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NESP48681 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NESP48681 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NESP48681 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NESP48681 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NESP48681 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NESP48681 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NESP48681 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NESP48681 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms