Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms