Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms