Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK1P39086 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms