Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP214P35658 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP214P35658 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP214P35658 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP214P35658 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP214P35658 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP214P35658 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP214P35658 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP214P35658 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP214P35658 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP214P35658 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP214P35658 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP214P35658 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP214P35658 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP214P35658 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP214P35658 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP214P35658 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP214P35658 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP214P35658 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP214P35658 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP214P35658 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP214P35658 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP214P35658 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms