Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms