Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms