Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms