Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA5P28066 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms