Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO2P25791 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO2P25791 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO2P25791 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms