Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPREP23469 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPREP23469 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPREP23469 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPREP23469 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPREP23469 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPREP23469 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPREP23469 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPREP23469 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPREP23469 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPREP23469 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPREP23469 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPREP23469 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPREP23469 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPREP23469 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPREP23469 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPREP23469 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPREP23469 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPREP23469 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPREP23469 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPREP23469 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPREP23469 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPREP23469 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPREP23469 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPREP23469 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPREP23469 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPREP23469 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPREP23469 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPREP23469 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPREP23469 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPREP23469 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPREP23469 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPREP23469 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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