Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DESP17661 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DESP17661 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DESP17661 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DESP17661 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DESP17661 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DESP17661 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DESP17661 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DESP17661 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DESP17661 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DESP17661 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DESP17661 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DESP17661 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DESP17661 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DESP17661 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DESP17661 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DESP17661 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DESP17661 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DESP17661 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms