Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODC1P11926 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODC1P11926 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms