Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD8BP10966 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD8BP10966 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms