Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GLI4P10075 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms