Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIMD1P0DJR0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms