Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms