Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms