Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOP08100 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOP08100 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms