Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB1P08034 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB1P08034 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB1P08034 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB1P08034 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB1P08034 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB1P08034 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB1P08034 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB1P08034 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB1P08034 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB1P08034 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB1P08034 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB1P08034 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB1P08034 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB1P08034 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB1P08034 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB1P08034 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB1P08034 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB1P08034 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB1P08034 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB1P08034 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB1P08034 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB1P08034 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB1P08034 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB1P08034 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB1P08034 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJB1P08034 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJB1P08034 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJB1P08034 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJB1P08034 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJB1P08034 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJB1P08034 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJB1P08034 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJB1P08034 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJB1P08034 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJB1P08034 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJB1P08034 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJB1P08034 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJB1P08034 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJB1P08034 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJB1P08034 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB1P08034 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms